นักวิจัย ทีมวิจัยจีโนมิกส์ (ฺBIOTEC) - สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ (สวทช.)
เปิดรับสมัครตำแหน่ง นักวิจัย
ทีมวิจัยจีโนมิกส์ (BIOTEC)

ระดับการศึกษา : ปริญญาเอก
สาขาวิชา : เทคโนโลยีชีวภาพเกษตร เทคโนโลยีชีวภาพพืช ชีววิทยาโมเลกุล การเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืช การถ่ายยีน การปรับปรุงพันธุ์พืช การแก้ไขจีโนม
ประสบการณ์ : 1 ปีขึ้นไป
ด้าน : สำเร็จการศึกษาระดับปริญญาเอกในสาขาที่กำหนดหรือสาขาที่เกี่ยวข้อง โดยเคยผ่านการเรียนหรือฝึกอบรมและเคยดำเนินงานวิจัยด้านการแก้ไขจีโนมด้วยระบบ CRISPR/Cas การชักนำให้เกิดต้นใหม่ การตรวจวิเคราะห์ระดับโมเลกุล หรือการวิเคราะห์ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ จะได้รับการพิจารณาเป็นพิเศษ

ทักษะที่จำเป็นสำหรับตำแหน่ง :
1. มีความรู้และประสบการณ์ด้านการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืช การแยกและเพาะเลี้ยงเซลล์โพรโทพลาสต์ และการชักนำให้เกิดต้นใหม่ (plant regeneration) ในพืชหลายชนิด เช่น อ้อย มะเขือเทศ มะละกอ กล้วยไม้ และเบญจมาศ
2. มีประสบการณ์ด้านการแก้ไขจีโนมพืชด้วยระบบ CRISPR/Cas ในพืชเศรษฐกิจ เช่น อ้อยและมะเขือเทศ ครอบคลุมตั้งแต่การวางแผนการทดลอง การนำส่งระบบแก้ไขจีโนม จนถึงการตรวจยืนยันพืชที่ได้รับการแก้ไขจีโนม
3. สามารถคัดเลือกยีนเป้าหมายโดยบูรณาการข้อมูลการระบุตำแหน่งและหน้าที่ของยีน ผลการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วจีโนม (GWAS) ข้อมูลการแสดงออกของยีน ข้อมูลจีโนมเปรียบเทียบ และหลักฐานจากวรรณกรรมหรือการศึกษาหน้าที่ของยีน
4. สามารถออกแบบไกด์อาร์เอ็นเอ (guide RNA, gRNA) ชนิดต่าง ๆ เช่น sgRNA, crRNA และ pegRNA ประเมินตำแหน่งนอกเป้าหมาย (off-target) ด้วยวิธีเชิงคำนวณ และเลือกใช้ระบบแก้ไขจีโนมให้เหมาะสมกับวัตถุประสงค์
5. มีทักษะด้านการออกแบบเวกเตอร์และชุดโครงสร้างดีเอ็นเอ การโคลนระดับโมเลกุล ตลอดจนการเตรียมไรโบนิวคลีโอโปรตีน (RNP) สำหรับการแก้ไขจีโนมแบบไม่ใช้ดีเอ็นเอ
6. มีประสบการณ์ในการนำส่งระบบแก้ไขจีโนมเข้าสู่เซลล์และเนื้อเยื่อพืชด้วยวิธี Agrobacterium-mediated transformation และ particle bombardment และสามารถเลือกวิธีให้เหมาะสมกับชนิดพืชและเนื้อเยื่อเป้าหมาย
7. มีทักษะการตรวจสอบและคัดกรองพืชในระดับโมเลกุล ได้แก่ การสกัดดีเอ็นเอ PCR gel electrophoresis การหาลำดับนิวคลีโอไทด์ และ amplicon sequencing เพื่อยืนยันการแก้ไขจีโนม
8. สามารถวิเคราะห์ข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ รูปแบบการแทรกหรือการขาดหายของเบส (indel) สถานะของแอลลีล ประสิทธิภาพการแก้ไขจีโนม และผลการตรวจสอบตำแหน่งนอกเป้าหมายได้
9. สามารถออกแบบและวางแผนงานวิจัย วิเคราะห์และแก้ไขปัญหาระหว่างการทดลอง วางแผนประเมินลักษณะปรากฏของพืช ตลอดจนสืบค้นวรรณกรรม สื่อสารภาษาอังกฤษเชิงวิชาการ และทำงานร่วมกับทีมแบบสหสาขาได้


หน้าที่ความรับผิดชอบ :
1. วางแผนและดำเนินงานวิจัยด้านการแก้ไขจีโนมพืชแบบครบวงจร ตั้งแต่การกำหนดโจทย์ การวางแผนชุดควบคุม จำนวนตัวอย่างและการทำซ้ำทางชีวภาพ จนถึงการประเมินผลของการแก้ไขจีโนม
2. วิเคราะห์ข้อมูลจีโนมิกส์ ผล GWAS ข้อมูลการแสดงออกของยีน ข้อมูลจีโนมเปรียบเทียบ และหลักฐานจากวรรณกรรม เพื่อคัดเลือกและจัดลำดับความสำคัญของยีนเป้าหมาย
3. ออกแบบไกด์อาร์เอ็นเอชนิดที่เหมาะสม เช่น sgRNA crRNA หรือ pegRNA ประเมินตำแหน่งนอกเป้าหมาย และคัดเลือกระบบแก้ไขจีโนมให้เหมาะสมกับวัตถุประสงค์ของโครงการ
4. ออกแบบและสร้างเวกเตอร์หรือชุดโครงสร้างดีเอ็นเอ รวมทั้งเตรียมระบบ RNP สำหรับนำไปใช้ในการแก้ไขจีโนมพืช
5. ดำเนินการนำส่งระบบแก้ไขจีโนมเข้าสู่เซลล์หรือเนื้อเยื่อพืชด้วยวิธีที่เหมาะสม และประสานงานการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อและการชักนำให้เกิดต้นใหม่
6. ตรวจคัดกรองและยืนยันพืชที่ได้รับการแก้ไขจีโนมด้วยเทคนิคระดับโมเลกุลและการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ พร้อมประเมินรูปแบบการเปลี่ยนแปลงและประสิทธิภาพการแก้ไขจีโนม
7. ตรวจสอบตำแหน่งนอกเป้าหมายด้วยวิธีที่เหมาะสม และคัดเลือกพืชที่ปราศจากยีนแปลกปลอม transgene-free เมื่อเกี่ยวข้องกับระบบที่ใช้
8. วางแผนประเมินลักษณะปรากฏของพืช รวมทั้งวิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่างการเปลี่ยนแปลงของจีโนมกับลักษณะที่แสดงออกในรุ่นหรือระยะการพัฒนาที่เหมาะสม
9. จัดทำและปรับปรุงวิธีปฏิบัติงานมาตรฐาน SOP บันทึกข้อมูลการทดลองอย่างเป็นระบบ และจัดการข้อมูลให้สามารถตรวจสอบย้อนกลับและทำซ้ำการทดลองได้ รวมทั้งปฏิบัติตามข้อกำหนดด้านความปลอดภัยทางชีวภาพ และจัดเตรียมเอกสารสำหรับเสนอคณะกรรมการความปลอดภัยทางชีวภาพระดับสถาบัน IBC
10. จัดทำข้อเสนอโครงการ รายงานความก้าวหน้า รายงานผลการวิจัย และผลงานตีพิมพ์ รวมทั้งสนับสนุนการจัดเตรียมข้อมูลสำหรับการคุ้มครองทรัพย์สินทางปัญญาหรือการถ่ายทอดเทคโนโลยีตามความเหมาะสม
11. ทำงานร่วมกับทีมชีวสารสนเทศ ทีมเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อ ทีมห้องปฏิบัติการ และหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง รวมทั้งถ่ายทอดเทคนิคและให้คำแนะนำแก่ผู้ช่วยวิจัย

สามารถสอบถามข้อมูล รายละเอียดอื่นๆ เพิ่มเติมได้ที่ : งานสรรหาคัดเลือก
โทรศัพท์: 025647000 ต่อ   71121
E-mail: recruit@nstda.or.th